Erstmals erwähnt wird der Ort im Pappenheimer Urbar von 1214. Funde weisen auf eine frühe Besiedlung hin. Dominantes Bauwerk im Ort ist das Schlösschen, entstanden im 14. Jh. und im 19. Jh. Landsitz des Johann Baptist Freiherr von Flachslanden, Geheimer Rat und Großballi. Nach dessen Tod folgten mehrfache Besitzerwechsel und Umbauten. Durch einen Brand 1998 erheblich zerstört, wurde das Gebäude in den folgenden Jahren vollständig saniert. Hessellohe war seit dem 19. Jh. Teil der Gemeinde Ried und wurde am 1. Januar 1976 in die Große Kreisstadt Neuburg an der Donau eingemeindet.
